工学系大学は大学全体ではなく自分の希望分野ごとに比較すべき？

はい。希望する工学分野が決まっているなら、大学全体の知名度や印象だけでなく、その分野を学べる学科・コースごとに、カリキュラム、教員や研究室、実験・設備、学修支援などを比較するのが有用です。同時に、入試、費用、通学、大学全体の支援も確認しましょう。分野が未定なら、学科変更の柔軟性や学べる分野の幅も重要です。