男子学生が多い工学系学科は人によって居心地が悪いこともある？

はい、男子学生が多い環境を居心地悪く感じる学生はいます。ただし、感じ方は性別だけで決まらず、友人関係、授業や研究室の雰囲気、教職員の対応などによっても異なります。大学には相談窓口や支援制度が設けられている場合もあるため、学科の男女比だけでなく、公式情報や見学・説明会などで実際の雰囲気を確認するとよいでしょう。